Protein–RNA interactions for Protein: Q03391

Grin2d, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2dQ03391 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2dQ03391 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2dQ03391 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2dQ03391 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2dQ03391 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms