Protein–RNA interactions for Protein: Q02526

Zfp41, Zinc finger protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp41Q02526 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp41Q02526 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp41Q02526 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp41Q02526 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp41Q02526 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp41Q02526 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp41Q02526 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp41Q02526 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp41Q02526 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp41Q02526 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp41Q02526 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp41Q02526 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp41Q02526 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms