Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcqQ02111 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkcqQ02111 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms