Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Top2aQ01320 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Top2aQ01320 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Top2aQ01320 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Top2aQ01320 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms