Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EgfrQ01279 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EgfrQ01279 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EgfrQ01279 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms