Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp1Q00915 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbp1Q00915 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms