Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lama4P97927 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lama4P97927 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lama4P97927 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lama4P97927 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lama4P97927 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lama4P97927 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Lama4P97927 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lama4P97927 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lama4P97927 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lama4P97927 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lama4P97927 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lama4P97927 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lama4P97927 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lama4P97927 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lama4P97927 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lama4P97927 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lama4P97927 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lama4P97927 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lama4P97927 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lama4P97927 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lama4P97927 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lama4P97927 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms