Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarcc1P97496 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarcc1P97496 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarcc1P97496 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarcc1P97496 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarcc1P97496 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarcc1P97496 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarcc1P97496 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarcc1P97496 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarcc1P97496 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarcc1P97496 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarcc1P97496 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarcc1P97496 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarcc1P97496 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarcc1P97496 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarcc1P97496 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms