Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx2P80206 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otx2P80206 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otx2P80206 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otx2P80206 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otx2P80206 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otx2P80206 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otx2P80206 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Otx2P80206 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx2P80206 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx2P80206 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms