Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf3P70671 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf3P70671 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf3P70671 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf3P70671 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf3P70671 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf3P70671 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf3P70671 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf3P70671 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf3P70671 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf3P70671 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf3P70671 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irf3P70671 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf3P70671 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf3P70671 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf3P70671 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf3P70671 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irf3P70671 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irf3P70671 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irf3P70671 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms