Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Erbb2P70424 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Erbb2P70424 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb2P70424 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erbb2P70424 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms