Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Cux2P70298 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Cux2P70298 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Cux2P70298 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Cux2P70298 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cux2P70298 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cux2P70298 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cux2P70298 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cux2P70298 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Cux2P70298 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cux2P70298 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cux2P70298 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Cux2P70298 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Cux2P70298 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cux2P70298 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cux2P70298 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cux2P70298 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Cux2P70298 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
Cux2P70298 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Cux2P70298 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Cux2P70298 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Cux2P70298 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Cux2P70298 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Cux2P70298 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Cux2P70298 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Cux2P70298 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cux2P70298 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cux2P70298 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cux2P70298 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cux2P70298 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cux2P70298 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cux2P70298 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cux2P70298 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Cux2P70298 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cux2P70298 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cux2P70298 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Cux2P70298 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cux2P70298 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms