Protein–RNA interactions for Protein: P70158

Smpdl3a, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3aP70158 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpdl3aP70158 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smpdl3aP70158 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpdl3aP70158 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smpdl3aP70158 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms