Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SbdsP70122 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SbdsP70122 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SbdsP70122 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SbdsP70122 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SbdsP70122 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SbdsP70122 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SbdsP70122 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SbdsP70122 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SbdsP70122 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SbdsP70122 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SbdsP70122 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SbdsP70122 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SbdsP70122 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SbdsP70122 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SbdsP70122 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SbdsP70122 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms