Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcbP68404 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcbP68404 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrkcbP68404 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkcbP68404 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms