Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp2P63044 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp2P63044 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms