Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng7P62956 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng7P62956 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng7P62956 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng7P62956 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms