Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snrpd3P62320 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpd3P62320 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.2 ms