Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpaP58389 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpaP58389 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpaP58389 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpaP58389 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpaP58389 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpaP58389 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpaP58389 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpaP58389 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpaP58389 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpaP58389 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpaP58389 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpaP58389 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpaP58389 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpaP58389 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms