Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dpf3P58269 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dpf3P58269 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dpf3P58269 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dpf3P58269 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms