Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SmoP56726 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SmoP56726 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SmoP56726 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SmoP56726 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmoP56726 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmoP56726 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmoP56726 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmoP56726 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SmoP56726 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmoP56726 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmoP56726 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmoP56726 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmoP56726 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SmoP56726 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmoP56726 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmoP56726 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmoP56726 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SmoP56726 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmoP56726 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmoP56726 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmoP56726 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmoP56726 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmoP56726 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SmoP56726 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmoP56726 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmoP56726 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmoP56726 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmoP56726 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmoP56726 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmoP56726 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SmoP56726 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SmoP56726 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SmoP56726 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SmoP56726 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmoP56726 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmoP56726 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmoP56726 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmoP56726 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmoP56726 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmoP56726 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmoP56726 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmoP56726 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmoP56726 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SmoP56726 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SmoP56726 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SmoP56726 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmoP56726 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmoP56726 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmoP56726 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmoP56726 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmoP56726 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SmoP56726 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmoP56726 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmoP56726 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SmoP56726 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmoP56726 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmoP56726 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmoP56726 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmoP56726 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmoP56726 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmoP56726 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmoP56726 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmoP56726 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmoP56726 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmoP56726 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmoP56726 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmoP56726 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmoP56726 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmoP56726 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmoP56726 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmoP56726 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmoP56726 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmoP56726 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmoP56726 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmoP56726 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmoP56726 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmoP56726 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmoP56726 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmoP56726 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmoP56726 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmoP56726 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmoP56726 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SmoP56726 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SmoP56726 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SmoP56726 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SmoP56726 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SmoP56726 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SmoP56726 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SmoP56726 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmoP56726 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmoP56726 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmoP56726 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmoP56726 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmoP56726 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmoP56726 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmoP56726 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmoP56726 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SmoP56726 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmoP56726 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms