Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd38P56528 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd38P56528 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd38P56528 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd38P56528 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd38P56528 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd38P56528 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd38P56528 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd38P56528 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd38P56528 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd38P56528 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd38P56528 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd38P56528 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd38P56528 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd38P56528 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd38P56528 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd38P56528 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms