Protein–RNA interactions for Protein: P55850

Dsc3, Desmocollin-3, mousemouse

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc3P55850 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsc3P55850 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc3P55850 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsc3P55850 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms