Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Faf1P54731 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Faf1P54731 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Faf1P54731 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Faf1P54731 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Faf1P54731 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Faf1P54731 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms