Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PklrP53657 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PklrP53657 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PklrP53657 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PklrP53657 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PklrP53657 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PklrP53657 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PklrP53657 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PklrP53657 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PklrP53657 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PklrP53657 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PklrP53657 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PklrP53657 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PklrP53657 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PklrP53657 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PklrP53657 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PklrP53657 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PklrP53657 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PklrP53657 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PklrP53657 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PklrP53657 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PklrP53657 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PklrP53657 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PklrP53657 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PklrP53657 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PklrP53657 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PklrP53657 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PklrP53657 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PklrP53657 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PklrP53657 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PklrP53657 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PklrP53657 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PklrP53657 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PklrP53657 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PklrP53657 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PklrP53657 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PklrP53657 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PklrP53657 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PklrP53657 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PklrP53657 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PklrP53657 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PklrP53657 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PklrP53657 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PklrP53657 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PklrP53657 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PklrP53657 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PklrP53657 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PklrP53657 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PklrP53657 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PklrP53657 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PklrP53657 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PklrP53657 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PklrP53657 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PklrP53657 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PklrP53657 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PklrP53657 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PklrP53657 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PklrP53657 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PklrP53657 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PklrP53657 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PklrP53657 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PklrP53657 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PklrP53657 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PklrP53657 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PklrP53657 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PklrP53657 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PklrP53657 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PklrP53657 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PklrP53657 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PklrP53657 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PklrP53657 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PklrP53657 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PklrP53657 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PklrP53657 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PklrP53657 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PklrP53657 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PklrP53657 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PklrP53657 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PklrP53657 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PklrP53657 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PklrP53657 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PklrP53657 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PklrP53657 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PklrP53657 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PklrP53657 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PklrP53657 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PklrP53657 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PklrP53657 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PklrP53657 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PklrP53657 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PklrP53657 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PklrP53657 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PklrP53657 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PklrP53657 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PklrP53657 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PklrP53657 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PklrP53657 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PklrP53657 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PklrP53657 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PklrP53657 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms