Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApodP51910 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApodP51910 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApodP51910 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApodP51910 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApodP51910 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApodP51910 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApodP51910 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApodP51910 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApodP51910 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApodP51910 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApodP51910 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApodP51910 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApodP51910 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ApodP51910 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ApodP51910 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApodP51910 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApodP51910 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApodP51910 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApodP51910 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApodP51910 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApodP51910 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApodP51910 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApodP51910 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApodP51910 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApodP51910 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ApodP51910 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ApodP51910 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ApodP51910 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApodP51910 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApodP51910 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApodP51910 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApodP51910 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ApodP51910 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApodP51910 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApodP51910 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApodP51910 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApodP51910 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApodP51910 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApodP51910 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApodP51910 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApodP51910 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApodP51910 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApodP51910 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ApodP51910 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApodP51910 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApodP51910 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApodP51910 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApodP51910 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApodP51910 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApodP51910 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApodP51910 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApodP51910 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApodP51910 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApodP51910 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApodP51910 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApodP51910 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApodP51910 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApodP51910 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApodP51910 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApodP51910 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApodP51910 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApodP51910 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApodP51910 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApodP51910 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApodP51910 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApodP51910 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApodP51910 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApodP51910 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApodP51910 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApodP51910 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ApodP51910 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApodP51910 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApodP51910 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApodP51910 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApodP51910 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApodP51910 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApodP51910 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApodP51910 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApodP51910 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApodP51910 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApodP51910 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApodP51910 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ApodP51910 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ApodP51910 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ApodP51910 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ApodP51910 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ApodP51910 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ApodP51910 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ApodP51910 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ApodP51910 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ApodP51910 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ApodP51910 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ApodP51910 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ApodP51910 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ApodP51910 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ApodP51910 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ApodP51910 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ApodP51910 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ApodP51910 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms