Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa10P50708 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa10P50708 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa10P50708 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa10P50708 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa10P50708 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa10P50708 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa10P50708 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa10P50708 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa10P50708 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa10P50708 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa10P50708 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms