Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FanccP50652 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FanccP50652 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FanccP50652 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FanccP50652 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FanccP50652 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FanccP50652 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FanccP50652 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FanccP50652 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FanccP50652 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FanccP50652 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FanccP50652 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FanccP50652 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FanccP50652 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FanccP50652 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FanccP50652 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FanccP50652 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FanccP50652 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FanccP50652 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FanccP50652 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FanccP50652 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FanccP50652 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FanccP50652 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FanccP50652 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FanccP50652 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FanccP50652 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FanccP50652 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FanccP50652 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FanccP50652 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FanccP50652 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FanccP50652 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FanccP50652 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FanccP50652 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FanccP50652 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FanccP50652 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FanccP50652 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FanccP50652 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FanccP50652 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FanccP50652 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FanccP50652 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FanccP50652 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FanccP50652 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FanccP50652 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FanccP50652 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FanccP50652 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FanccP50652 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FanccP50652 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FanccP50652 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FanccP50652 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FanccP50652 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FanccP50652 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FanccP50652 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FanccP50652 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FanccP50652 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FanccP50652 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FanccP50652 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FanccP50652 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FanccP50652 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FanccP50652 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FanccP50652 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FanccP50652 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FanccP50652 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FanccP50652 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FanccP50652 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FanccP50652 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FanccP50652 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FanccP50652 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FanccP50652 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FanccP50652 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FanccP50652 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FanccP50652 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FanccP50652 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FanccP50652 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FanccP50652 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FanccP50652 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FanccP50652 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FanccP50652 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FanccP50652 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FanccP50652 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FanccP50652 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FanccP50652 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FanccP50652 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FanccP50652 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FanccP50652 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FanccP50652 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FanccP50652 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FanccP50652 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FanccP50652 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FanccP50652 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FanccP50652 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FanccP50652 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FanccP50652 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FanccP50652 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FanccP50652 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FanccP50652 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FanccP50652 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FanccP50652 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FanccP50652 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FanccP50652 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FanccP50652 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms