Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpbP50405 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpbP50405 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpbP50405 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpbP50405 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpbP50405 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpbP50405 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpbP50405 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpbP50405 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpbP50405 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpbP50405 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SftpbP50405 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SftpbP50405 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms