Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnni3P48787 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnni3P48787 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni3P48787 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms