Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcd1P48410 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcd1P48410 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms