Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sipa1P46062 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sipa1P46062 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms