Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh2P43247 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Msh2P43247 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh2P43247 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh2P43247 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh2P43247 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Msh2P43247 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msh2P43247 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh2P43247 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msh2P43247 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh2P43247 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh2P43247 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh2P43247 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms