Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtgfrP43117 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtgfrP43117 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtgfrP43117 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms