Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elk3P41971 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elk3P41971 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Elk3P41971 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Elk3P41971 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elk3P41971 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Elk3P41971 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Elk3P41971 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Elk3P41971 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elk3P41971 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elk3P41971 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms