Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Chd1P40201 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Chd1P40201 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Chd1P40201 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Chd1P40201 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Chd1P40201 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Chd1P40201 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Chd1P40201 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Chd1P40201 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Chd1P40201 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Chd1P40201 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Chd1P40201 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Chd1P40201 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Chd1P40201 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Chd1P40201 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Chd1P40201 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Chd1P40201 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Chd1P40201 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Chd1P40201 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.1 ms