Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grin1P35438 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grin1P35438 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grin1P35438 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grin1P35438 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grin1P35438 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grin1P35438 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin1P35438 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin1P35438 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin1P35438 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin1P35438 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin1P35438 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms