Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd1P33215 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd1P33215 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd1P33215 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd1P33215 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd1P33215 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd1P33215 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nedd1P33215 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nedd1P33215 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nedd1P33215 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nedd1P33215 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nedd1P33215 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nedd1P33215 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd1P33215 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 659.9 ms