Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccnd3P30282 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccnd3P30282 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccnd3P30282 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnd3P30282 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.1 ms