Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
OatP29758 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
OatP29758 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
OatP29758 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
OatP29758 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
OatP29758 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
OatP29758 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
OatP29758 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
OatP29758 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
OatP29758 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
OatP29758 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
OatP29758 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,36■■□□□ 1,65
OatP29758 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
OatP29758 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
OatP29758 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
OatP29758 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25,35■■□□□ 1,65
OatP29758 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
OatP29758 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
OatP29758 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
OatP29758 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
OatP29758 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
OatP29758 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
OatP29758 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25,34■■□□□ 1,65
OatP29758 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,33■■□□□ 1,65
OatP29758 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
OatP29758 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
OatP29758 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
OatP29758 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
OatP29758 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25,32■■□□□ 1,64
OatP29758 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
OatP29758 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
OatP29758 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
OatP29758 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
OatP29758 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
OatP29758 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
OatP29758 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25,31■■□□□ 1,64
OatP29758 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
OatP29758 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
OatP29758 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
OatP29758 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,3■■□□□ 1,64
OatP29758 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
OatP29758 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
OatP29758 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
OatP29758 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
OatP29758 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
OatP29758 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25,28■■□□□ 1,64
OatP29758 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25,28■■□□□ 1,64
OatP29758 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25,28■■□□□ 1,64
OatP29758 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
OatP29758 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
OatP29758 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
OatP29758 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
OatP29758 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
OatP29758 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
OatP29758 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
OatP29758 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25,27■■□□□ 1,64
OatP29758 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
OatP29758 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
OatP29758 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
OatP29758 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
OatP29758 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
OatP29758 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
OatP29758 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
OatP29758 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
OatP29758 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
OatP29758 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
OatP29758 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
OatP29758 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
OatP29758 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25,22■■□□□ 1,63
OatP29758 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25,22■■□□□ 1,63
OatP29758 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
OatP29758 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
OatP29758 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
OatP29758 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
OatP29758 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
OatP29758 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
OatP29758 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
OatP29758 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,2■■□□□ 1,62
OatP29758 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25,2■■□□□ 1,62
OatP29758 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
OatP29758 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
OatP29758 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
OatP29758 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
OatP29758 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
OatP29758 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
OatP29758 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
OatP29758 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
OatP29758 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
OatP29758 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
OatP29758 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
OatP29758 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25,16■■□□□ 1,62
OatP29758 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
OatP29758 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
OatP29758 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
OatP29758 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
OatP29758 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
OatP29758 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
OatP29758 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
OatP29758 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
OatP29758 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46,3 ms