Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Marcksl1P28667 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Marcksl1P28667 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms