Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc6a9P28571 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a9P28571 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms