Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Aco1P28271 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Aco1P28271 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aco1P28271 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aco1P28271 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aco1P28271 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Aco1P28271 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Aco1P28271 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Aco1P28271 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aco1P28271 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aco1P28271 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms