Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vav1P27870 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vav1P27870 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vav1P27870 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vav1P27870 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vav1P27870 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vav1P27870 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vav1P27870 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vav1P27870 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vav1P27870 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vav1P27870 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vav1P27870 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vav1P27870 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vav1P27870 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vav1P27870 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vav1P27870 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vav1P27870 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vav1P27870 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vav1P27870 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vav1P27870 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vav1P27870 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms