Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lef1P27782 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lef1P27782 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lef1P27782 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lef1P27782 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lef1P27782 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lef1P27782 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lef1P27782 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lef1P27782 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lef1P27782 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lef1P27782 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lef1P27782 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lef1P27782 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lef1P27782 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lef1P27782 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms