Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CftrP26361 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CftrP26361 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CftrP26361 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CftrP26361 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CftrP26361 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CftrP26361 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CftrP26361 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CftrP26361 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CftrP26361 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CftrP26361 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CftrP26361 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CftrP26361 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CftrP26361 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
CftrP26361 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CftrP26361 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
CftrP26361 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CftrP26361 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CftrP26361 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CftrP26361 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CftrP26361 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CftrP26361 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CftrP26361 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CftrP26361 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CftrP26361 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CftrP26361 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CftrP26361 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CftrP26361 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CftrP26361 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CftrP26361 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CftrP26361 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CftrP26361 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CftrP26361 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
CftrP26361 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CftrP26361 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CftrP26361 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CftrP26361 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CftrP26361 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CftrP26361 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CftrP26361 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CftrP26361 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CftrP26361 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
CftrP26361 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CftrP26361 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CftrP26361 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CftrP26361 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CftrP26361 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CftrP26361 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CftrP26361 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CftrP26361 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CftrP26361 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CftrP26361 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CftrP26361 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CftrP26361 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
CftrP26361 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CftrP26361 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CftrP26361 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CftrP26361 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CftrP26361 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CftrP26361 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CftrP26361 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CftrP26361 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CftrP26361 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CftrP26361 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CftrP26361 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CftrP26361 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CftrP26361 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CftrP26361 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CftrP26361 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CftrP26361 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CftrP26361 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CftrP26361 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CftrP26361 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CftrP26361 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
CftrP26361 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CftrP26361 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CftrP26361 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CftrP26361 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CftrP26361 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CftrP26361 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CftrP26361 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CftrP26361 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CftrP26361 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CftrP26361 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CftrP26361 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CftrP26361 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CftrP26361 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CftrP26361 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CftrP26361 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CftrP26361 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CftrP26361 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CftrP26361 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CftrP26361 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CftrP26361 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CftrP26361 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CftrP26361 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CftrP26361 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CftrP26361 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
CftrP26361 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CftrP26361 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms