Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ChgaP26339 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ChgaP26339 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ChgaP26339 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ChgaP26339 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ChgaP26339 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ChgaP26339 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ChgaP26339 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ChgaP26339 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ChgaP26339 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ChgaP26339 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ChgaP26339 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ChgaP26339 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ChgaP26339 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ChgaP26339 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ChgaP26339 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms