Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd247P24161 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd247P24161 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd247P24161 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd247P24161 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd247P24161 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd247P24161 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd247P24161 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd247P24161 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd247P24161 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms