Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfyaP23708 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfyaP23708 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfyaP23708 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfyaP23708 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms