Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfyaP23708 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfyaP23708 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfyaP23708 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfyaP23708 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfyaP23708 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfyaP23708 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms