Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Eif3aP23116 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Eif3aP23116 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Eif3aP23116 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Eif3aP23116 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Eif3aP23116 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Eif3aP23116 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Eif3aP23116 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Eif3aP23116 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
Eif3aP23116 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Eif3aP23116 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Eif3aP23116 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Eif3aP23116 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Eif3aP23116 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Eif3aP23116 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Eif3aP23116 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Eif3aP23116 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Eif3aP23116 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eif3aP23116 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms